Okulumuz 26.11.1952 tarihinde Mut Ortaokulu olarak 7 kız, 26 erkek öğrenciyle Mut Kalesi önündeki binada eğitim-öğretime başlamıştır. Bu durum 1968-1969 eğitim-öğretim yılının sonunu kadar devam etmiştir. Bu arada Ortaokul bünyesinde kurulan, Ortaokul ve Lise yaptırma ve Yaşatma Derneğinin çalışmaları ile şimdiki lise binamızın yeri istimlak edilmiştir. Daha sonra Milli Eğitim Bakanlığı tarafından istimlak edilen yere A blok inşa edilerek 1969-1970 öğretim yılında Mut Lisesi olarak 55 kız, 134 erkek öğrenci ile eğitim- öğretime başlamıştır.
1969-1970 Eğitim Öğretime başlayan lisemiz bünyesindeki ortaokul 1986-1987 eğitim- öğretim yılında kapatılmış ve sadece lise olarak eğitim- öğretime devam etmiştir.
1993-1994 eğitim- öğretim yılından itibaren bakanlık genelgesi doğrultusunda ismi Mut Çok Programlı Lisesi olarak değiştirilen okulumuz 1996-1997 eğitim- öğretim yılında faliyete geçen B blok ile birlikte, 2 blokta “ Mut Çok Programlı Lisesi” olarak faaliyetini 2002 yılına kadar sürdürmüştür.
2002-2003 eğitim- öğretim yılı içerisinde Milli Eğitim Bakanlığının 16.07.2002 tarih ve 7616 sayılı oluru ile tekrar “ Mut Lisesi” olarak açılmıştır.
2010-2011 Eğitim-Öğretim yılında Mut’a Anadolu Öğretmen Lisesi açılmış ancak bu okula bina bulunamamıştır. Dolayısıyla bu okul Mut Lisesi’nin A Blok 2. Katında eğitim-öğretimine devam etmiştir.
2012-2013 eğitim-öğretim yılının 2. döneminden itibaren okulumuzun adı MUT ŞEHİT EMİN ÇELİK ANADOLU LİSESİ olarak değiştirilmiştir. Halen aynı isimle eğitim-öğretimine devam etmektedir.
2014-2015 eğitim-öğretim yılında hizmete geçmek üzere okulumuzun bahçesine 200 kişilik pansiyon yapılmıştır.
